Bastiaan Tops

2023

Amplification of the PLAG-family genes—PLAGL1 and PLAGL2—is a key feature of the novel tumor type CNS embryonal tumor with PLAGL amplification

Keck, M. K., Sill, M., Wittmann, A., Joshi, P., Stichel, D., Beck, P., Okonechnikow, K., Sievers, P., Wefers, A. K., Roncaroli, F., Avula, S., McCabe, M. G., Hayden, J. T., Wesseling, P., Øra, I., Nistér, M., Kranendonk, M. E. G., Tops, B. B. J., Zapotocky, M. & Zamecnik, J. & 36 anderen, Vasiljevic, A., Fenouil, T., Meyronet, D., von Hoff, K., Schüller, U., Loiseau, H., Figarella-Branger, D., Kramm, C. M., Sturm, D., Scheie, D., Rauramaa, T., Pesola, J., Gojo, J., Haberler, C., Brandner, S., Jacques, T., Sexton Oates, A., Saffery, R., Koscielniak, E., Baker, S. J., Yip, S., Snuderl, M., Ud Din, N., Samuel, D., Schramm, K., Blattner-Johnson, M., Selt, F., Ecker, J., Milde, T., von Deimling, A., Korshunov, A., Perry, A., Pfister, S. M., Sahm, F., Solomon, D. A. & Jones, D. T. W., jan. 2023, In: Acta Neuropathologica. 145, 1, blz. 49-69 21 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

10 Citaten (Scopus)

Genetic variants found in paediatric oncology patients with severe chemotherapy-induced toxicity: A case series

Bernsen, E. C., Hanff, L. M., Haveman, L. M., Tops, B., van der Lee, M., Swen, J. J., Huitema, A. & Diekstra, M., jan. 2023, In: Journal of oncology pharmacy practice : official publication of the International Society of Oncology Pharmacy Practitioners. 29, 5, blz. 1237-1245 9 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Molecular diagnostic tools for the World Health Organization (WHO) 2021 classification of gliomas, glioneuronal and neuronal tumors; an EANO guideline

Sahm, F., Brandner, S., Bertero, L., Capper, D., French, P. J., Figarella-Branger, D., Giangaspero, F., Haberler, C., Hegi, M. E., Kristensen, B. W., Kurian, K. M., Preusser, M., Tops, B. B. J., van den Bent, M., Wick, W., Reifenberger, G. & Wesseling, P., 3 okt. 2023, In: Neuro-Oncology. 25, 10, blz. 1731-1749 19 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

Systematic discovery of gene fusions in pediatric cancer by integrating RNA-seq and WGS

van Belzen, I. A. E. M., Cai, C., van Tuil, M., Badloe, S., Strengman, E., Janse, A., Verwiel, E. T. P., van der Leest, D. F. M., Kester, L., Molenaar, J. J., Meijerink, J., Drost, J., Peng, W. C., Kerstens, H. H. D., Tops, B. B. J., Holstege, F. C. P., Kemmeren, P. & Hehir-Kwa, J. Y., 3 jul. 2023, In: BMC Cancer. 23, 1, blz. 618

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

2022

Implementation of paediatric precision oncology into clinical practice: The Individualized Therapies for Children with cancer program ‘iTHER’

Langenberg, K. P. S., Meister, M. T., Bakhuizen, J. J., Boer, J. M., van Eijkelenburg, N. K. A., Hulleman, E., Ilan, U., Looze, E. J., Dierselhuis, M. P., van der Lugt, J., Breunis, W., Schild, L. G., Ober, K., van Hooff, S. R., Scheijde-Vermeulen, M. A., Hiemcke-Jiwa, L. S., Flucke, U. E., Kranendonk, M. E. G., Wesseling, P. & Sonneveld, E. & 34 anderen, Punt, S., Boltjes, A., van Dijk, F., Verwiel, E. T. P., Volckmann, R., Hehir-Kwa, J. Y., Kester, L. A., Koudijs, M. M. J., Waanders, E., Holstege, F. C. P., Vormoor, H. J., Hoving, E. W., van Noesel, M. M., Pieters, R., Kool, M., Stumpf, M., Blattner-Johnson, M., Balasubramanian, G. P., Van Tilburg, C. M., Jones, B. C., Jones, D. T. W., Witt, O., Pfister, S. M., Jongmans, M. C. J., Kuiper, R. P., de Krijger, R. R., Wijnen, M. H. W., den Boer, M. L., Zwaan, C. M., Kemmeren, P., Koster, J., Tops, B. B. J., Goemans, B. F. & Molenaar, J. J., nov. 2022, In: European Journal of Cancer. 175, blz. 311-325 15 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

33 Citaten (Scopus)

Improved Gene Fusion Detection in Childhood Cancer Diagnostics Using RNA Sequencing

Hehir-Kwa, J. Y., Koudijs, M. J., Verwiel, E. T. P., Kester, L. A., van Tuil, M., Strengman, E., Buijs, A., Kranendonk, M. E. G., Hiemcke-Jiwa, L. S., de Haas, V., van de Geer, E., de Leng, W., van der Lugt, J., Lijnzaad, P., Holstege, F. C. P., Kemmeren, P. & Tops, B. B. J., jan. 2022, In: JCO precision oncology. 6, 6, blz. e2000504

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

21 Citaten (Scopus)

Infantile fibrosarcoma with an EGFR kinase domain duplication: Underlining a close relationship with congenital mesoblastic nephroma and highlighting a similar morphological spectrum

van Spronsen, R., Kester, L. A., Knops, R. R. G., van de Sande, M. A. J., van Leenders, G. J. L. H., de Laat, P. C. J., Stortelder, E., Korpershoek, E., van Noesel, M., Meister, M. T., Koerkamp, M. J. A. G., de Graaf, N., Giovannoni, I., Tops, B. B. J., de Krijger, R. R., Ter Horst, S. A. J., Flucke, U., Alaggio, R. & Hiemcke-Jiwa, L. S., apr. 2022, In: Annals of diagnostic pathology. 57, blz. 151885

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

12 Citaten (Scopus)

Mesenchymal tumor organoid models recapitulate rhabdomyosarcoma subtypes

Meister, M. T., Groot Koerkamp, M. J. A., de Souza, T., Breunis, W. B., Frazer-Mendelewska, E., Brok, M., DeMartino, J., Manders, F., Calandrini, C., Kerstens, H. H. D., Janse, A., Dolman, M. E. M., Eising, S., Langenberg, K. P. S., van Tuil, M., Knops, R. R. G., van Scheltinga, S. T., Hiemcke-Jiwa, L. S., Flucke, U. & Merks, J. H. M. & 9 anderen, van Noesel, M. M., Tops, B. B. J., Hehir-Kwa, J. Y., Kemmeren, P., Molenaar, J. J., van de Wetering, M., van Boxtel, R., Drost, J. & Holstege, F. C. P., 10 okt. 2022, In: EMBO molecular medicine. 14, 10, blz. e16001 e16001.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

25 Citaten (Scopus)

Molecular Characterization Reveals Subclasses of 1q Gain in Intermediate Risk Wilms Tumors

van Belzen, I. A. E. M., van Tuil, M., Badloe, S., Strengman, E., Janse, A., Verwiel, E. T. P., van der Leest, D. F. M., de Vos, S., Baker-Hernandez, J., Groenendijk, A., de Krijger, R., Kerstens, H. H. D., Drost, J., van den Heuvel-Eibrink, M. M., Tops, B. B. J., Holstege, F. C. P., Kemmeren, P. & Hehir-Kwa, J. Y., okt. 2022, In: Cancers. 14, 19, 4872.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

2 Citaten (Scopus)

Pleuropulmonary blastoma (PPB) and other DICER1-associated high-grade malignancies are morphologically, genetically and epigenetically related - A comparative study of 4 PPBs and 6 sarcomas

Hiemcke-Jiwa, L. S., van Belle, S., Eijkelenboom, A., Merks, J. H. M., van Noesel, M. M., Kaal, S. E. J., Pijnenborg, J. M. A., Bulten, J., Tops, B. B. J., van de Ven, C. P., van Gorp, J. M., de Krijger, R. R., Cheesman, E., Kelsey, A. M., Kester, L. A. & Flucke, U., okt. 2022, In: Annals of diagnostic pathology. 60, blz. 152002

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

5 Citaten (Scopus)

Trecode: A FAIR Eco-System for the Analysis and Archiving of Omics Data in a Combined Diagnostic and Research Setting

Kerstens, H., Hehir - Kwa, J., van de Geer, E., van Run, C., Badloe, S., Janse, A., Baker-Hernandez, J., de Vos, S., van der Leest, D. F. M., Verwiel, E. T. P., Tops, B. & Kemmeren, P., 23 dec. 2022, In: BioMedInformatics. blz. 1-16 16 blz., 1.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

2021

Loss of H3K27me3 occurs in a large subset of embryonal rhabdomyosarcomas: Immunohistochemical and molecular analysis of 25 cases

Tomassen, T., Kester, L. A., Tops, B. B., Driehuis, E., van Noesel, M. M., van Ewijk, R., van Gorp, J. M., Hulsker, C. C., Terwisscha-van Scheltinga, S. E. J., Merks, H. H. M., Flucke, U. & Hiemcke-Jiwa, L. S., jun. 2021, In: Annals of diagnostic pathology. 52, blz. 151735 151735.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

10 Citaten (Scopus)

Micro-costing diagnostics in oncology: from single-gene testing to whole- genome sequencing

Pasmans, C. T. B., Tops, B. B. J., Steeghs, E. M. P., Coupé, V. M. H., Grünberg, K., de Jong, E. K., Schuuring, E. M. D., Willems, S. M., Ligtenberg, M. J. L., Retèl, V. P., van Snellenberg, H., de Bruijn, E., Cuppen, E. & Frederix, G. W. J., 2021, In: Expert Review of Pharmacoeconomics and Outcomes Research. 21, 3, blz. 413-414 2 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

19 Citaten (Scopus)

PATZ1 fusions define a novel molecularly distinct neuroepithelial tumor entity with a broad histological spectrum

Alhalabi, K. T., Stichel, D., Sievers, P., Peterziel, H., Sommerkamp, A. C., Sturm, D., Wittmann, A., Sill, M., Jäger, N., Beck, P., Pajtler, K. W., Snuderl, M., Jour, G., Delorenzo, M., Martin, A. M., Levy, A., Dalvi, N., Hansford, J. R., Gottardo, N. G. & Uro-Coste, E. & 42 anderen, Maurage, C. A., Godfraind, C., Vandenbos, F., Pietsch, T., Kramm, C., Filippidou, M., Kattamis, A., Jones, C., Øra, I., Mikkelsen, T. S., Zapotocky, M., Sumerauer, D., Scheie, D., McCabe, M., Wesseling, P., Tops, B. B. J., Kranendonk, M. E. G., Karajannis, M. A., Bouvier, N., Papaemmanuil, E., Dohmen, H., Acker, T., von Hoff, K., Schmid, S., Miele, E., Filipski, K., Kitanovski, L., Krskova, L., Gojo, J., Haberler, C., Alvaro, F., Ecker, J., Selt, F., Milde, T., Witt, O., Oehme, I., Kool, M., von Deimling, A., Korshunov, A., Pfister, S. M., Sahm, F. & Jones, D. T. W., nov. 2021, In: Acta Neuropathologica. 142, 5, blz. 841-857 17 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

42 Citaten (Scopus)

The end of the laboratory developed test as we know it? Recommendations from a national multidisciplinary taskforce of laboratory specialists on the interpretation of the IVDR and its complications

Bank, P. C. D., Jacobs, L. H. J., Van Den Berg, S. A. A., Van Deutekom, H. W. M., Hamann, D., Molenkamp, R., Ruivenkamp, C. A. L., Swen, J. J., Tops, B. B. J., Wamelink, M. M. C., Wessels, E. & Oosterhuis, W. P., 1 feb. 2021, In: Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. 59, 3, blz. 491-497 7 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

34 Citaten (Scopus)

2020

Comprehensive routine diagnostic screening to identify predictive mutations, gene amplifications, and microsatellite instability in FFPE tumor material

Steeghs, E. M. P., Kroeze, L. I., Tops, B. B. J., Van Kempen, L. C., Ter Elst, A., Kastner-Van Raaij, A. W. M., Hendriks-Cornelissen, S. J. B., Hermsen, M. J. W., Jansen, E. A. M., Nederlof, P. M., Schuuring, E., Ligtenberg, M. J. L. & Eijkelenboom, A., 7 apr. 2020, In: BMC Cancer. 20, 1, 291.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

24 Citaten (Scopus)

2019

Comprehensive molecular and clinicopathological analysis of vascular malformations: A study of 319 cases

Ten Broek, R. W., Eijkelenboom, A., van der Vleuten, C. J. M., Kamping, E. J., Kets, M., Verhoeven, B. H., Grünberg, K., Schultze Kool, L. J., Tops, B. B. J., Ligtenberg, M. J. L. & Flucke, U., aug. 2019, In: Genes Chromosomes and Cancer. 58, 8, blz. 541-550 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

57 Citaten (Scopus)

Glucose and glutamine metabolism in relation to mutational status in NSCLC histological subtypes

Meijer, T. W. H., Looijen-Salamon, M. G., Lok, J., van den Heuvel, M., Tops, B., Kaanders, J. H. A. M., Span, P. N. & Bussink, J., 1 dec. 2019, In: Thoracic Cancer. 10, 12, blz. 2289-2299 11 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

21 Citaten (Scopus)

HER2, chromosome 17 polysomy and DNA ploidy status in breast cancer; a translational study

Halilovic, A., Verweij, D. I., Simons, A., Stevens-Kroef, M. J. P. L., Vermeulen, S., Elsink, J., Tops, B. B. J., Otte-Höller, I., van der Laak, J. A. W. M., van de Water, C., Boelens, O. B. A., Schlooz-Vries, M. S., Dijkstra, J. R., Nagtegaal, I. D., Tol, J., van Cleef, P. H. J., Span, P. N. & Bult, P., 1 dec. 2019, In: Scientific Reports. 9, 1, 11679.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

14 Citaten (Scopus)

Recommendations for the clinical interpretation and reporting of copy number gains using gene panel NGS analysis in routine diagnostics

Eijkelenboom, A., Tops, B. B. J., van den Berg, A., van den Brule, A. J. C., Dinjens, W. N. M., Dubbink, H. J., ter Elst, A., Geurts-Giele, W. R. R., Groenen, P. J. T. A., Groenendijk, F. H., Heideman, D. A. M., Huibers, M. M. H., Huijsmans, C. J. J., Jeuken, J. W. M., van Kempen, L. C., Korpershoek, E., Kroeze, L. I., de Leng, W. W. J., van Noesel, C. J. M. & Speel, E. J. M. & 5 anderen, Vogel, M. J., van Wezel, T., Nederlof, P. M., Schuuring, E. & Ligtenberg, M. J. L., 2019, (Geaccepteerd/In druk) In: Virchows Archiv.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

25 Citaten (Scopus)

2018

Simultaneous detection of lung fusions using a multiplex RT-PCR next generation sequencing-based approach: A multi-institutional research study

Vaughn, C. P., Costa, J. L., Feilotter, H. E., Petraroli, R., Bagai, V., Rachiglio, A. M., Marino, F. Z., Tops, B., Kurth, H. M., Sakai, K., Mafficini, A., Bastien, R. R. L., Reiman, A., Le Corre, D., Boag, A., Crocker, S., Bihl, M., Hirschmann, A., Scarpa, A. & Machado, J. C. & 8 anderen, Blons, H., Sheils, O., Bramlett, K., Ligtenberg, M. J. L., Cree, I. A., Normanno, N., Nishio, K. & Laurent-Puig, P., 16 aug. 2018, In: BMC Cancer. 18, 1, 828.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

23 Citaten (Scopus)

2017

BRCA testing by single-molecule molecular inversion probes

Neveling, K., Mensenkamp, A. R., Derks, R., Kwint, M., Ouchene, H., Steehouwer, M., Lier, B. V., Bosgoed, E., Rikken, A., Tychon, M., Zafeiropoulou, D., Castelein, S., Hehir-Kwa, J., Thung, D. T., Hofste, T., Lelieveld, S. H., Bertens, S. M. M., Adan, I. B. J. F., Eijkelenboom, A. & Tops, B. B. & 11 anderen, Yntema, H., Stokowy, T., Knappskog, P. M., Høberg-Vetti, H., Steen, V. M., Boyle, E., Martin, B., Ligtenberg, M. J. L., Shendure, J., Nelen, M. R. & Hoischen, A., feb. 2017, In: Clinical Chemistry. 63, 2, blz. 503-512 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

41 Citaten (Scopus)

Molecular profiles of benign and (pre)malignant endometrial lesions

van der Putten, L. J. M., van Hoof, R., Tops, B. B. J., Snijders, M. P. L. M., van den Berg-van Erp, S. H., van der Wurff, A. A. M., Bulten, J., Pijnenborg, J. M. A. & Massuger, L. F. A. G., 1 mrt. 2017, In: Carcinogenesis. 38, 3, blz. 329-335 7 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

34 Citaten (Scopus)

Mutational analysis using Sanger and next generation sequencing in sporadic spindle cell hemangiomas: A study of 19 cases

ten Broek, R. W., Bekers, E. M., de Leng, W. W. J., Strengman, E., Tops, B. B. J., Kutzner, H., Leeuwis, J. W., van Gorp, J. M., Creytens, D. H., Mentzel, T., van Diest, P. J., Eijkelenboom, A. & Flucke, U., dec. 2017, In: Genes Chromosomes and Cancer. 56, 12, blz. 855-860 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

18 Citaten (Scopus)

Novel BRCA1 and BRCA2 Tumor Test as Basis for Treatment Decisions and Referral for Genetic Counselling of Patients with Ovarian Carcinomas

Weren, R. D. A., Mensenkamp, A. R., Simons, M., Eijkelenboom, A., Sie, A. S., Ouchene, H., van Asseldonk, M., Gomez-Garcia, E. B., Blok, M. J., de Hullu, J. A., Nelen, M. R., Hoischen, A., Bulten, J., Tops, B. B. J., Hoogerbrugge, N. & Ligtenberg, M. J. L., 1 feb. 2017, In: Human Mutation. 38, 2, blz. 226-235 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

57 Citaten (Scopus)

Profiling of the metabolic transcriptome via single molecule molecular inversion probes

De Bitter, T., Van De Water, C., Van Den Heuvel, C., Zeelen, C., Eijkelenboom, A., Tops, B., Oosterwijk, E., Kolev, D., Mulders, P., Ter Laan, M., Van Lith, S. & Leenders, W., 1 dec. 2017, In: Scientific Reports. 7, 1, 11402.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

14 Citaten (Scopus)

Recurrent mutations in genes involved in nuclear factor-κB signalling in nodal marginal zone lymphoma—diagnostic and therapeutic implications

van den Brand, M., Rijntjes, J., Hebeda, K. M., Menting, L., Bregitha, C. V., Stevens, W. B. C., van der Velden, W. J. F. M., Tops, B. B. J., van Krieken, J. H. J. M. & Groenen, P. J. T. A., 1 jan. 2017, In: Histopathology. 70, 2, blz. 174-184 11 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

18 Citaten (Scopus)

Stable aneuploid tumors cells are more sensitive to TTK inhibition than chromosomally unstable cell lines

Libouban, M. A. A., de Roos, J. A. D. M., Uitdehaag, J. C. M., Willemsen-Seegers, N., Mainardi, S., Dylus, J., Man, J. D., Tops, B., Meijerink, J. P. P., Storchová, Z., Buijsman, R. C., Medema, R. H. & Zaman, G. J. R., 2017, In: Oncotarget. 8, 24, blz. 38309-38325 17 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

24 Citaten (Scopus)

Using a semi-conductor sequencing-based panel for genotyping of HPV-positive and HPV-negative oropharyngeal cancer: a retrospective pilot study

Ham, J. C., Tops, B. B. J., Driessen, C. M. L., van Raaij, A. W. M., Slootweg, P. J., Melchers, W. J. G., Ligtenberg, M. J. L. & van Herpen, C. M. L., jun. 2017, In: Clinical Otolaryngology. 42, 3, blz. 681-686 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

1 Citaat (Scopus)

2016

An impressive response to pazopanib in a patient with metastatic endometrial carcinoma

Van Der Steen, M. J., De Waal, Y. R. P., Westermann, A., Tops, B., Leenders, W. & Ottevanger, P. B., nov. 2016, In: Netherlands Journal of Medicine. 74, 9, blz. 410-413 4 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

10 Citaten (Scopus)

Identification of a novel inactivating mutation in Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1-R314C) in a high grade astrocytoma

Van Lith, S. A. M., Navis, A. C., Lenting, K., Verrijp, K., Schepens, J. T. G., Hendriks, W. J. A. J., Schubert, N. A., Venselaar, H., Wevers, R. A., Van Rooij, A., Wesseling, P., Molenaar, R. J., Van Noorden, C. J. F., Pusch, S., Tops, B. & Leenders, W. P. J., 27 jul. 2016, In: Scientific Reports. 6, 30486.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

12 Citaten (Scopus)

Myxoid liposarcoma of the foot: a study of 8 cases

Bekers, E. M., Song, W., Suurmeijer, A. J., Bonenkamp, J. J., van der Geest, I. C., Braam, P. M., Ploegmakers, M. J., Desar, I. M., Tops, B. B., van Gorp, J. M., Creytens, D. H., Mentzel, T. & Flucke, U., 1 dec. 2016, In: Annals of Diagnostic Pathology. 25, blz. 37-41 5 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

8 Citaten (Scopus)

Three Rounds of External Quality Assessment in France to Evaluate the Performance of 28 Platforms for Multiparametric Molecular Testing in Metastatic Colorectal and Non-Small Cell Lung Cancer

Dequeker, E. M. C., Keppens, C., Egele, C., Delen, S., Lamy, A., Lemoine, A., Sabourin, J. C., Andrieu, C., Ligtenberg, M., Fetique, D., Tops, B., Descarpentries, C., Blons, H., Denoux, Y., Aube, C., Penault-Llorca, F., Hofman, P., Leroy, K., Le Marechal, C. & Doucet, L. & 14 anderen, Duranton-Tanneur, V., Pedeutour, F., Soubeyran, I., Côté, J. F., Emile, J. F., Vignaud, J. M., Monhoven, N., Haddad, V., Laurent-Puig, P., Van Krieken, H., Nowak, F., Lonchamp, E., Bellocq, J. P. & Rouleau, E., 1 mrt. 2016, In: Journal of Molecular Diagnostics. 18, 2, blz. 205-214 10 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

25 Citaten (Scopus)

2015

A germline homozygous mutation in the base-excision repair gene NTHL1 causes adenomatous polyposis and colorectal cancer

Weren, R. D. A., Ligtenberg, M. J. L., Kets, C. M., de Voer, R. M., Verwiel, E. T. P., Spruijt, L., van Zelst-Stams, W. A. G., Jongmans, M. C., Gilissen, C., Hehir-Kwa, J. Y., Hoischen, A., Shendure, J., Boyle, E. A., Kamping, E. J., Nagtegaal, I. D., Tops, B. B. J., Nagengast, F. M., Geurts van Kessel, A., van Krieken, J. H. J. M. & Kuiper, R. P. & 1 anderen, Hoogerbrugge, N., jun. 2015, In: Nature Genetics. 47, 6, blz. 668-71 4 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

302 Citaten (Scopus)

Development of a semi-conductor sequencing-based panel for genotyping of colon and lung cancer by the Onconetwork consortium

Tops, B. B. J., Normanno, N., Kurth, H., Amato, E., Mafficini, A., Rieber, N., Le Corre, D., Rachiglio, M. M., Reiman, A., Sheils, O., Noppen, C., Lacroix, L., Cree, I. A., Scarpa, A., Ligtenberg, M. J. L. & Laurent-Puig, P., 31 jan. 2015, In: BMC Cancer. 15, 1, 26.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

45 Citaten (Scopus)

Identification of a novel MET mutation in high-grade glioma resulting in an auto-active intracellular protein

Navis, A. C., van Lith, S. A. M., van Duijnhoven, S. M. J., de Pooter, M., Yetkin-Arik, B., Wesseling, P., Hendriks, W. J. A. J., Venselaar, H., Timmer, M., van Cleef, P., van Bergen en Henegouwen, P., Best, M. G., Wurdinger, T. D., Tops, B. B. J. & Leenders, W. P. J., 17 jul. 2015, In: Acta Neuropathologica. 130, 1, blz. 131-144 14 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

36 Citaten (Scopus)

Immunoglobulin rearrangement analysis from multiple lesions in the same patient using next-generation sequencing

Appenzeller, S., Gilissen, C., Rijntjes, J., Tops, B. B. J., Kastner-van Raaij, A., Hebeda, K. M., Nissen, L., Dutilh, B. E., van Krieken, J. H. J. M. & Groenen, P. J. T. A., 1 dec. 2015, In: Histopathology. 67, 6, blz. 843-858 16 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

4 Citaten (Scopus)

Next generation sequencing in synovial sarcoma reveals novel gene mutations

Vlenterie, M., Hillebrandt-Roeffen, M. H. S., Flucke, U. E., Groenen, P. J. T. A., Tops, B. B. J., Kamping, E. J., Pfundt, R., De Bruijn, D. R. H., Geurts Van Kessel, A. H. M., Van Krieken, H. J. H. J. M., Van Der Graaf, W. T. A. & Versleijen-Jonkers, Y. M. H., 2015, In: Oncotarget. 6, 33, blz. 34680-34690 11 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

44 Citaten (Scopus)

RAS testing in metastatic colorectal cancer: Excellent reproducibility amongst 17 Dutch pathology centers

Dutch RAS EQA Initiative, 2015, In: Oncotarget. 6, 17, blz. 15681-15689 9 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

12 Citaten (Scopus)

Safety and activity of the first-in-class Sym004 anti-EGFR antibody mixture in patients with refractory colorectal cancer

Dienstmann, R., Patnaik, A., Garcia-Carbonero, R., Cervantes, A., Benavent, M., Roselló, S., Tops, B. B. J., van der Post, R. S., Argilés, G., Skartved, N. J. Ø., Hansen, U. H., Hald, R., Pedersen, M. W., Kragh, M., Horak, I. D., Braun, S., Van Cutsem, E., Tolcher, A. W. & Tabernero, J., 2015, In: Cancer Discovery. 5, 6, blz. 598-609 12 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

71 Citaten (Scopus)

The homogeneous mutation status of a 22 gene panel justifies the use of serial sections of colorectal cancer tissue for external quality assessment

Dijkstra, J. R., Tops, B. B. J., Nagtegaal, I. D., van Krieken, J. H. J. M. & Ligtenberg, M. J. L., 1 okt. 2015, In: Virchows Archiv. 467, 3, blz. 273-278 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

9 Citaten (Scopus)

2014

Adrenal nodularity and somatic mutations in primary aldosteronism: One node is the culprit?

Dekkers, T., Ter Meer, M., Lenders, J. W. M., Hermus, A. R. M., Schultze Kool, L., Langenhuijsen, J. F., Nishimoto, K., Ogishima, T., Mukai, K., Azizan, E. A. B., Tops, B., Deinum, J. & Küsters, B., jul. 2014, In: Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 99, 7, blz. E1341-1351

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

99 Citaten (Scopus)

Desmoid-type fibromatosis of the head and neck region in the paediatric population: A clinicopathological and genetic study of seven cases

Flucke, U., Tops, B. B. J., Van Diest, P. J. & Slootweg, P. J., mei 2014, In: Histopathology. 64, 6, blz. 769-776 8 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

38 Citaten (Scopus)

Increased mitochondrial activity in a novel IDH1-R132H mutant human oligodendroglioma xenograft model: In situ detection of 2-HG and α-KG

Navis, A. C., Niclou, S. P., Fack, F., Stieber, D., van Lith, S., Verrijp, K., Wright, A., Stauber, J., Tops, B., Otte-Holler, I., Wevers, R. A., van Rooij, A., Pusch, S., von Deimling, A., Tigchelaar, W., van Noorden, C. J. F., Wesseling, P. & Leenders, W. P. J., 27 jan. 2014, In: Acta neuropathologica communications. 2, 1, 18.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

50 Citaten (Scopus)

2013

Presence of C11orf95-MKL2 fusion is a consistent finding in chondroid lipomas: A study of eight cases

Flucke, U., Tops, B. B. J., de Saint Aubain Somerhausen, N., Bras, J., Creytens, D. H., Küsters, B., Groenen, P. J. T. A., Verdijk, M. A. J., Suurmeijer, A. J. H. & Mentzel, T., mei 2013, In: Histopathology. 62, 6, blz. 925-930 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

43 Citaten (Scopus)

Significance of complete 1p/19q co-deletion, IDH1 mutation and MGMT promoter methylation in gliomas: Use with caution

Boots-Sprenger, S. H. E., Sijben, A., Rijntjes, J., Tops, B. B. J., Idema, A. J., Rivera, A. L., Bleeker, F. E., Gijtenbeek, A. M., Diefes, K., Heathcock, L., Aldape, K. D., Jeuken, J. W. M. & Wesseling, P., jul. 2013, In: Modern Pathology. 26, 7, blz. 922-929 8 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

88 Citaten (Scopus)

Somatic mutations in ATP1A1 and CACNA1D underlie a common subtype of adrenal hypertension

Azizan, E. A. B., Poulsen, H., Tuluc, P., Zhou, J., Clausen, M. V., Lieb, A., Maniero, C., Garg, S., Bochukova, E. G., Zhao, W., Shaikh, L. H., Brighton, C. A., Teo, A. E. D., Davenport, A. P., Dekkers, T., Tops, B., Küsters, B., Ceral, J., Yeo, G. S. H. & Neogi, S. G. & 13 anderen, McFarlane, I., Rosenfeld, N., Marass, F., Hadfield, J., Margas, W., Chaggar, K., Solar, M., Deinum, J., Dolphin, A. C., Farooqi, I. S., Striessnig, J., Nissen, P. & Brown, M. J., sep. 2013, In: Nature Genetics. 45, 9, blz. 1055-1060 6 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

437 Citaten (Scopus)

2012

EWSR1-ATF1 chimeric transcript in a myoepithelial tumor of soft tissue: A case report

Flucke, U., Mentzel, T., Verdijk, M. A., Slootweg, P. J., Creytens, D. H., Suurmeijer, A. J. H. & Tops, B. B. J., mei 2012, In: Human Pathology. 43, 5, blz. 764-768 5 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

95 Citaten (Scopus)

NR4A3 rearrangement reliably distinguishes between the clinicopathologically overlapping entities myoepithelial carcinoma of soft tissue and cellular extraskeletal myxoid chondrosarcoma

Flucke, U., Tops, B. B. J., Verdijk, M. A. J., Van Cleef, P. J. H., Van Zwam, P. H., Slootweg, P. J., Bovée, J. V. M. G., Riedl, R. G., Creytens, D. H., Suurmeijer, A. J. H. & Mentzel, T., jun. 2012, In: Virchows Archiv. 460, 6, blz. 621-628 8 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

63 Citaten (Scopus)

2011

Evaluating experimental bias and completeness in comparative phosphoproteomics analysis

Boekhorst, J., Boersema, P. J., Tops, B. B. J., van Breukelen, B., Heck, A. J. R. & Snel, B., 2011, In: PLoS ONE. 6, 8, e23276.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Artikel › peer review

Open Access

12 Citaten (Scopus)

Bastiaan Tops

Onderzoeksoutput

Zoekresultaten